1、膜組件的更換。超純水系統中的超濾膜組件的使用壽命是由產品質量、運行條件等因素來決定的，一般來講，反洗頻率、化學清洗頻率等對使用壽命有較大的影響。

2、控制系統和閥門容易受到損壞。因為設備在長期運行之后會產生一些物質，所以需頻繁的反洗，不過超濾裝置的閥門容易損壞。因此，對于使用次數較多的閥門其質量要高；

3、容易造成斷絲。因為大部分的超濾設備材料采用的是中空纖維絲，在運行的過程中因為膜絲震動太大容易出現斷絲的現象。斷絲以后會引起水質量的變化，所以應迅速確定斷絲的準確位置，采取相應的措施。對斷絲的處理一般的找出破損的膜絲，進行封堵或者更換新元件。

4、出現污堵現象。在運行過程中，膜出現污堵是常見的現象，污堵的速度、化學清洗后的恢復率，決定著超濾能否使用。通過實驗來選擇超濾膜的種類、運行方式，并對其反洗工藝、殺菌工藝和化學清洗工藝進行實驗，找到減緩超濾膜通量下降的方法，并對不可逆污堵的情況進行預測。